تسببت الأمطار الطوفانية التي شهدتها ولاية القيروان يوم السبت الماضي 5 أكتوبر 2013 في لحاق أضرار مادية جسيمة بجامع عقبة بن نافع.
وأدت مياه الأمطار التي تسربت إلى داخل الجامع إتلاف قدر كبير من المحتويات التي كانت داخله، إضافة إلى الرائحة الكريهة التي نتجت عن اختلاط مياه الأمطار بمياه الصرف الصحي.